Se estou certo é preciso um user daqui seguir uma comunidade lá para iniciar a ligação a essa comunidade. Depois de uns minutos, tenta novamente que deve aparecer

Desculpa a resposta demorada, apanhaste-me de férias :) Voltarei em breve.

Que comunidades não consegues aceder? Eu de vez em quando publico nalgumas e nunca me deparei com problemas.
Vejo várias na lista de todas as comunidades aqui. Devido à natureza do fediverso, não se vêem todas as comunidades de uma instância remota, por omissão. Só depois de alguém interagir pela primeira vez é que aparecem. Basta, por exemplo, pesquisares pelo link e deve ficar disponível.

Em todo o caso, eu vou experiementar com as que me deres e tentar perceber o que possa estar mal.

Não.